En la década de 2000, el DDG-182 Mirai, un ultra sofisticado destructor de autodefensa de la Armada japonesa, se dirigió a América del Sur para unirse a una fuerza internacional encargada de proteger a las poblaciones amenazadas por Guerra civil. En el camino, el barco queda atrapado en una depresión climática con extrañas consecuencias; Después de esto, Mirai y su tripulación viajan en el tiempo para reunirse el 4 de junio de 1942, en la víspera de la Batalla de Midway.
Una vez que su sorpresa ha terminado, los hombres de Mirai se preguntan cómo reintegrar su tiempo, y rápidamente se dan cuenta de que tendrán que estar muy atentos para no alterar el curso de la historia. Sin embargo, a raíz de la Batalla de Midway, el segundo del barco Yosuke Kadomatsu rescata a un oficial japonés, Takumi Kusaka, atrapado en el hundimiento de un hidroavión, no puede dejarse morir.
Los hombres del Mirai pronto descubrirán que Kusaka está demostrando ser un hombre de inteligencia formidable; este último toma conocimiento del futuro que le espera a Japón y decide hacer todo lo posible para cambiar el curso de la historia y crear un Japón idealizado: Zipang. Kadomatsu, asumiendo la responsabilidad de las consecuencias de sus acciones, continuará demandando a Kusaka para tratar de detenerlo.
