Tras una fuerte tormenta en mar abierto, Link encalló en las playas de la isla de Cocolint.
Atrapado en esta isla desconocida, nuestro héroe no tiene más remedio que despertar al pez de los sueños (en las garras de las pesadillas en su huevo) gracias a los Instrumentos de sirena dispersos en diferentes mazmorras.
Nuestro héroe será asistido en su tarea por varios personajes, incluido su mentor: el Búho.